Rafferty zmarł w swoim domu po długiej chorobie. Do ostatnich chwil towarzyszyła mu jego córka, Martha.

Przyczyny śmierci nie są znane. Wiadomo jednak, że w przeszłości muzyk walczył z uzależnieniem od alkoholu i poddawał się leczeniu z powodu niedomagań wątroby.

Początki muzycznej kariery Gerry`ego Rafferty`ego wiążą się z graniem w londyńskim metrze. W 1972 roku wokalista założył własną grupę rockową, Stealers Wheel. Wraz z nią Rafferty zarejestrował utwór „Stuck In The Middle With You”, który olbrzymią popularność zyskał po tym, jak Quentin Tarantino włączył go do ścieżki dźwiękowej do filmu „Wściekłe psy” (1992).

Rafferty ma także na koncie solowy przebój – „Baker Street” z 1975 r. (któż nie zna tego saksofonu!):